ANLong-jie,FENGDa-ling,SHIBao-sheng.CloningandSequenceAnalysisofWD40TranscriptionalRegulatorofAcerpalmatum[J].Northern Horticulture,2012,36(12):148-152.
血红鸡爪槭叶片WD40转录因子的克隆及序列分析
- Title:
- CloningandSequenceAnalysisofWD40TranscriptionalRegulatorofAcerpalmatum
- 文章编号:
- 1001-0009(2012)12-0148-05
- Keywords:
- Acerpalmatum; WD40transcriptionalfactor; genecloning; sequenceanalysis
- 分类号:
- S792.35
- 文献标志码:
- A
- 摘要:
- 以血鸡爪槭叶片总RNA为模板,采用RT-PCR和RACE-PCR的方法,研究血红鸡爪槭叶片花色素苷的合成机理,成功获得了调控花色素苷表达的转录因子WD40基因。结果表明:WD40基因全长1104bp,编码337个氨基酸。通过NCBI中的Blast软件对其进行核苷酸序列和氨基酸序列的同源性进行分析,表明所获得的核苷酸序列和推导的氨基酸序列与其它物种的转录因子WD40有较高的同源性,并且C端含有4个WD重复基序,推断该基因为血红鸡爪槭的WD40转录因子。
- Abstract:
- WithAcerpalmatumasmaterials,totalRNAwasisolatedfromtheleafofAcerpalmatumandactedastemplateforreversetranscriptionpolymerasechainreaction(RT-PCR).Theresultsshowedthatthefull-lengthcDNAencodingatranscriptionalfactorwasclonedviaRACE-PCRmethodandthecDNAcontainedanORFof1104bpencoding337aminoacids.ThroughBlastsoftwareinNCBI,thenucleotidesequenceandtheaminoacidsequenceoftheleafofAcerpalmatumwereanalyzed.TheresultsshowedthatthenucleotideandaminoacidsequencesofthecDNAinAcerpalmatumwerehighlyhomologouswiththoseoftheWD40transcriptionfactorinotherspecies,andfourconservedWDrepeatmotifwerepresentedintheC-terminalofaminoacidsequences,whichsuggestedthesequencewasWD40 transcriptionfactorgene.
参考文献/References:
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备注/Memo
第一作者简介:安龙杰(1985-),男,河北石家庄人,在读硕士,现主要从事园林植物与观赏园艺研究工作。E-mail:251704490@qq.com。
责任作者:史宝胜(1969-),男,河北高阳人,博士,副教授,现主要从事园林植物与观赏园艺方面的研究工作。E-mail:baoshengshi@163.com。
基金项目:林木育种国家工程实验室开放课题资助项目(FOP2010-5)。
收稿日期:2012-04-09