CHEN Yahan,LU Yunshuang,HE Zhilan,et al.Identification and Molecular Evolutionary Analysis of Jasmine Virus T Infecting Jasmine in Gansu Province[J].Northern Horticulture,2024,(17):61-66.[doi:10.11937/bfyy.20240199]
侵染甘肃茉莉的茉莉T病毒鉴定及分子进化分析
- Title:
- Identification and Molecular Evolutionary Analysis of Jasmine Virus T Infecting Jasmine in Gansu Province
- 文章编号:
- 1001-0009(2024)17-0061-06
- Keywords:
- jasmine; jasmine T virus; virus detection; CP; molecular evolutionary analysis
- 分类号:
- S 436
- 文献标志码:
- A
- 摘要:
- 以表现黄色环纹症状的8份茉莉叶片为试材，采用RT-PCR方法，研究了待测茉莉的病毒种类及茉莉T病毒（jasmine virus T，JaVT）外壳蛋白（coat protein，CP）基因序列遗传多样性，以期为茉莉病毒病的防治提供参考依据。结果表明:4份样品中检测到JaVT，并扩增出4条JaVT的外壳蛋白（CP）基因序列。4个JaVT分离物CP基因间核苷酸序列的一致性为92.20%~95.20%，与NCBI已发表的4个JaVT CP基因核苷酸序列一致性为91.40%~94.00%。基于8个JaVT CP基因全长序列进行系统发育分析，结果表明该研究中的4个JaVT分离物与来自中国的JaVT-MZ962345聚集在一起。8条JaVT全长CP基因序列中检测到3个重组事件。这是甘肃省首次报道茉莉T病毒。
- Abstract:
- Eight jasmine leaves showing yellow ring were used as experimental material.And the pathogen causing jasmine virus disease and the nucleic acid sequence,genetic diversity of jasmine virus T (JaVT) were analyzed by RT-PCR,in order to provide reference for the prevention and treatment of jasmine virus disease.The results showed that JaVT was isolated from 4 samples,and 4 CP gene sequences of JaVT were amplified.The nucleotide sequence identity among the CP genes of the four JaVT isolates was 92.20%-95.20%,and the nucleotide sequence identity between the CP genes of the four JaVT isolates was 91.40%-94.00% with the other 4 JaVT CP genes published in NCBI.Phylogenetic analysis based on the full-length sequences of 8 JaVT CP genes.The results showed that the four JaVT isolates in this study were clustered with JaVT-MZ962345 from China.Three recombination events were detected in 8 JaVT full-length CP gene sequences.
参考文献/References:
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相似文献/References:
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备注/Memo
第一作者简介：陈雅寒（1988-），女，博士，副教授，现主要从事植物病毒学等研究工作。E-mail：yahanch@163.com.基金项目：甘肃农业大学人才启动金资助项目（GAU-KYQD-2019-22）；国家自然科学基金资助项目（32160628）；甘肃省自然科学基金资助项目（21JR7RA820）；甘肃省高等学校创新基金资助项目（2021B-117）。收稿日期：2024-01-12