SHEN Penglong,DONG Chengming,XIA Wei,et al.Genetic Diversity of EST-SSR Markers in Forsythia suspensa (Oleaceae) From Different Habitats[J].Northern Horticulture,2019,43(13):140-147.[doi:10.11937/bfyy.20183742]
不同产地连翘EST-SSR标记遗传多样性研究
- Title:
- Genetic Diversity of EST-SSR Markers in Forsythia suspensa (Oleaceae) From Different Habitats
- Keywords:
- Forsythia suspensa; EST-SSR; genetic diversity; genetic similarity
- 文献标志码:
- A
- 摘要:
- 以采自连翘主产区河南和山西12个产地的77份连翘种质资源为试材，采用EST-SSR分子标记技术分析其遗传多样性，以期探索不同产地连翘的遗传相似性以及其关键影响因素。结果表明：从60对引物中筛选出14对扩增条带清晰，稳定性好的多态性EST-SSR 引物，14对引物在77份样品中共扩增出370条带，多态性条带368条，多态位点百分率为99.46%，12个产地的遗传距离范围是0.020 3～0.092 2，平均遗传距离为0.055 8。根据遗传相似系数对12个产地进行聚类分析，在0.935处把12个居群聚为5类；同时对77份样品进行聚类分析，在0.72处把77份样品聚为5类，个体聚类结果与产地聚类结果相似。聚类结果分析表明，连翘的遗传相似性与地理距离没有显著的相关性，主要与生长环境以及海拔等因素有关。试验结果揭示了不同产地连翘遗传相似度的关键因素，为连翘亲缘关系的鉴定、连翘资源的保护与开发奠定了基础。
- Abstract:
- The genetic diversity of 77 Forsythia suspensa germplasm resources collected from 12 areas of Henan and Shanxi Provinces was analyzed by EST-SSR molecular marker technique，in order to explore the genetic similarity of Forsythia suspensa in different habitats and its key influencing factors.The results showed that 14 pairs of polymorphic EST-SSR primers with clear amplified bands and good stability were screened from 60 pairs of primers.14 pairs of primers amplified 370 bands in 77 samples，including 368 polymorphic bands，and the percentage of polymorphic sites was 99.46%.The genetic distances of the 12 areas ranged from 0.020 3 to 0.092 2，and the average genetic distance was 0.055 8.According to genetic similarity coefficient，12 populations were clustered into 5 groups at 0.935 sites and 77 samples were clustered into 5 classes at 0.935 sites.The result of individual clustering was similar to that of origin.The analysis of clustering results showed that the genetic similarity of Forsythia suspensa had no significant correlation with geographical distance，which was mainly related to growth environment and altitude，etc.The experimental results reveal the key factors of genetic similarity of Forsythia suspensa in different habitats,which lays a foundation for the identification of Forsythia suspensa susceptibility and the protection and development of Forsythia resources.
参考文献/References:
[1]滕训辉.山西野生连翘资源保护与可持续利用研究[J].中国医药导报，2010，7(34)：81-82，115.[2]郭丁丁,张潞,朱秀峰.中药连翘种质资源调查报告[J].时珍国医国药，2012，23(10)：2601-2603.[3]崔旭盛,李鑫,王伟,等.连翘适宜采收期研究[J].安徽农业科学，2017，45(11)：107-108，137.[4]阎新佳,温静,项峥,等.连翘的化学成分研究[J].中草药，2017，48(4)：644-647.[5]全云云,袁岸,龚小红,等.连翘抗炎药效物质基础筛选研究[J].天然产物研究与开发，2017，29(3)：435-438，471.[6]LANG Y,WANG M,XIA J，et al.Effects of soil drought stress on photosynthetic gas exchange traits and chlorophyll fluorescence in Forsythia suspensa[J].Journal of Forestry Research，2018，29(1)：45-53.[7]XIA Y,YANG B,LIANG J，et al.Caffeoyl phenylethanoid glycosides from unripe fruits of Forsythia suspensa[J].Chemistry of Natural Compounds，2015，51(4)：656-659.[8]PAN X,CAO X,LI N，et al.Forsythin inhibits lipopolysaccharide-induced inflammation by suppressing jak-stat and p38 mapk signalings and ros production[J].Inflammation Research，2014，63(7)：597-608.[9]孟南,苏芳,李永.鸡公山和桐柏山连翘遗传多样性分析[J].河南科学，2011，29(3)：297-300.[10]李永,杨攀,李永华.伏牛山区连翘遗传多样性研究[J].西北植物学报，2011，31(4)：665-670.[11]FU Z,LI Y H,LI Y，et al.Isolation and characterization of microsatellite markers for Forsythia suspensa (Thunb.)Vahl (Oleaceae) using 454 sequencing technology[J].Biochemical Systematics and Ecology，2014，57：328-331.[12]FU Z,LEI Y,PENG D，et al.Population genetics of the widespread shrub Forsythia suspensa (oleaceae) in warm-temperate china using microsatellite loci：Implication for conservation[J].Plant Systematics and Evolution，2016，302(1)：1-9.[13]王玲玲,陈东亮,黄丛林,等.SSR分子标记技术在植物研究中的应用[J].安徽农业科学，2017，45(36)：123-126，130.[14]贺润丽,樊杰,平莉莉,等.大豆基因组SSR和EST-SSR在黄芪中的通用性分析[J].分子植物育种，2015，13(5)：994-998.[15]刘果,谢耀坚,陈鸿鹏,等.桉树Genomic-SSR和EST-SSR分子标记的遗传差异性分析[J].桉树科技，2017，34(3)：1-8.[16]张亚东,彭婵,李振芳,等.基因组SSR与EST-SSR标记在杨树不同种间的遗传差异[J].东北林业大学学报，2011，39(12)：8-11，117.[17]王兴春,谭河林,陈钊,等.基于RNA-Seq技术的连翘转录组组装与分析及SSR分子标记的开发[J].中国科学(生命科学)，2015，45(3)：301-310.[18]王竹林.遗传学实验指导[M].杨凌:西北农林科技大学出版社，2011：70-73.[19]强海平,余国辉,刘海泉,等.基于SSR标记的中美紫花苜蓿品种遗传多样性研究[J].中国农业科学，2014，47(14)：2853-2862.[20]汤正辉,祝亚军,谭晓风,等.河南连翘种群遗传多样性的ISSR分析[J].中南林业科技大学学报，2013，33(8)：32-37.[21]孟令芝.基于高通量测序技术的连翘转录组分析及SSR分子标记的开发[D].晋中：山西农业大学，2014.[22]葛亮,袁素霞,王春城,等.百合部分种及品种系统进化关系的EST-SSR标记分析[J].园艺学报，2012，39(11)：2189-2198.[23]邵千顺,高磊,南雄雄,等.利用SSR技术对十七份枸杞材料进行遗传多样性分析及标准指纹图谱构建[J].北方园艺，2015(12)：91-95.
相似文献/References:
[1]梁美霞.连翘茎尖培养与快速繁殖研究[J].北方园艺,2012,36(18):139.
LIANG Mei-xia.Study on Shoot Tips Culture and Rapid Propagation of Forsythia suspensa[J].Northern Horticulture,2012,36(13):139.
[2]杨志刚,朱栋,罗兵,等.三十七个山东牡丹品种DNA指纹图谱构建与EST-SSR标记遗传多样性分析[J].北方园艺,2015,39(07):77.[doi:10.11937/bfyy.201507024]
YANG Zhi-gang,ZHU Dong,LUO Bing,et al.Construction of Fingerprint and Analysis of Genetic Diversity with EST-SSR Markers for Thirty-seven Peony Cultivars in Shandong[J].Northern Horticulture,2015,39(13):77.[doi:10.11937/bfyy.201507024]
[3]吴子龙,赵昕,叶嘉,等.连翘精油的提取及其抗菌保鲜效果的研究[J].北方园艺,2016,40(11):131.[doi:10.11937/bfyy.201611034]
WU Zilong,ZHAO Xin,YE Jia,et al.Extraction of Essential Oil and Its Effect on Antibacterial Preservation of Forsythia suspensa[J].Northern Horticulture,2016,40(13):131.[doi:10.11937/bfyy.201611034]
[4]常 宏 志.干 旱 半 干 旱 地 区 连 翘 育 苗 技 术[J].北方园艺,2009,33(03):0.[doi:10.11937/bfyy.200903072]
[J].Northern Horticulture,2009,33(13):0.[doi:10.11937/bfyy.200903072]
[5]黄 鹏.连翘开发利用前景及规范化栽培技术[J].北方园艺,2009,33(03):0.[doi:10.11937/bfyy.200903076]
[J].Northern Horticulture,2009,33(13):0.[doi:10.11937/bfyy.200903076]
[6]裴红宾,高凤琴.连翘在山西的立地范围及其开发利用价值[J].北方园艺,2006,30(02):0.[doi:10.11937/bfyy.200602060]
[J].Northern Horticulture,2006,30(13):0.[doi:10.11937/bfyy.200602060]
[7]张恩亮,王鹏,李亚,等.紫薇EST-SSR标记的开发与利用[J].北方园艺,2016,40(22):107.[doi:10.11937/bfyy.201622027]
ZHANG Enliang,WANG Peng,LI Ya,et al.Development and Utility of EST-SSR Markers in Lagerstroemia indica[J].Northern Horticulture,2016,40(13):107.[doi:10.11937/bfyy.201622027]
[8]夏伟,董诚明,牛建斌,等.连翘根系土壤中氮、磷、钾含量与药材有效成分含量的相关性分析[J].北方园艺,2016,40(24):142.[doi:10.11937/bfyy.201624036]
XIA Wei,DONG Chengming,NIU Jianbin,et al.Correlation Analysis of N，P，K Content in Forsythia Root Soil and Medicine Effective Component Content[J].Northern Horticulture,2016,40(13):142.[doi:10.11937/bfyy.201624036]
[9]秦雪,陈淑英,田嘉,等.天山樱桃EST-SSR引物开发及PCR反应体系优化[J].北方园艺,2017,41(12):108.[doi:10.11937/bfyy.201712026]
QIN Xue,CHEN Shuying,TIAN Jia,et al.Development of EST-SSR Markers and Optimization of SSR System in Cerasus tianschanica[J].Northern Horticulture,2017,41(13):108.[doi:10.11937/bfyy.201712026]
[10]黄鹏.连翘全光喷雾扦插育苗试验[J].北方园艺,2018,42(19):145.[doi:10.11937/bfyy.20180150]
HUANG Peng.Experiment of Forsythia suspensa With All Light Spray Cuttings[J].Northern Horticulture,2018,42(13):145.[doi:10.11937/bfyy.20180150]
备注/Memo
第一作者简介：申鹏龙（1991-），男，硕士研究生，研究方向为中药资源保护与开发。E-mail：872691905@qq.com.责任作者：董诚明（1963-），男，本科，教授，研究方向为中药材规范化种植。E-mail：dcm371@sohu.com.基金项目：中央引导地方科技发展专项资助项目（2016年度）。收稿日期：2018-12-07