[1]常婧,刘青柏,刘明国.酸枣SSR-PCR反应体系优化[J].北方园艺,2018,42(12):50-57.[doi:10.11937/bfyy.20174451]
　CHANG Jing,LIU Qingbai,LIU Mingguo.Optimization of SSR-PCR Reaction System for Ziziphus acidojujuba[J].Northern Horticulture,2018,42(12):50-57.[doi:10.11937/bfyy.20174451]
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酸枣SSR-PCR反应体系优化

《北方园艺》[ISSN:1001-0009/CN:23-1247/S] 卷: 第42卷 期数: 2018年12 页码: 50-57 栏目: 出版日期: 2018-05-01
Title:
Optimization of SSR-PCR Reaction System for Ziziphus acidojujuba
作者:
常婧1; 2; 刘青柏1; 刘明国1
（1.沈阳农业大学 林学院，辽宁 沈阳 110866；2.辽宁省森林经营研究所，辽宁 丹东 118002）
Author(s):
CHANG Jing1; 2; LIU Qingbai1; LIU Mingguo1
(1.College of Forestry，Shenyang Agricultural University，Shenyang，Liaoning 110866；2.Liaoning Institute of Forest Management，Dandong，Liaoning 118002)
关键词:
酸枣; SSR-PCR反应体系; 优化; 正交设计
Keywords:
Zizyphus acidojujuba; SSR-PCR reaction system;  optimization;  orthogonal design
DOI:
10.11937/bfyy.20174451
文献标志码:
A
摘要:
以3个酸枣品系LW1、LW2、LW23为试材，以大枣品种“三星”为对照，采用L16（45）正交实验设计，研究了酸枣SSR-PCR的反应体系，以期为酸枣SSR分子标记研究提供参考依据。结果表明：酸枣SSR-PCR的最佳反应体系为，总体系为20 μL，DNA模板量100 ng 、引物浓度05 μmol·L-1、Mg2+浓度125 mmol·L-1、Taq聚合酶量15 U、dNTPs浓度03 mmol·L-1。利用该体系，选择引物JSSR250对53个酸枣品系和8个大枣品种的DNA进行扩增，酸枣的扩增产物在140~180 bp，具7个等位基因，目标条带清晰，多态性良好。该体系能够应用于酸枣SSR分子标记研究。
Abstract:
Three Zizyphus acidojujuba clones LW1,LW2,LW23 were used as experimental materials，‘Sanxing’ Ziziphus jujuba was as control，by orthogonal experimental design L16 (45)，the reaction system of SSR-PCR was established in order to provide the basis in the research method on SSR molecular markers of Zizyphus acidojujuba.The results showed that the optimal systems of SSR（20 μL） was DNA templates 100 ng，primer concentration 05 μmol·L-1，Mg2+ concentration 125 mol·L-1,Taq DNA polymerase 15 U，dNTPs concentration 03 mmol·L-1.By the reaction system，using primer JSSR250，DNA amplification of 53 Zizyphus acidojujuba clones and 8 Ziziphus jujuba varieties was carried out，which showed that the target strips were clear and the amplification products ranged from 140-180 bp，with 7 alleles.The optimal reaction systems could be used for the SSR molecular marker development of Zizyphus acidojujuba.

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　CHANG Jing,LIU Qingbai,LIU Mingguo.Optimization of SSR-PCR Reaction System for Ziziphus acidojujuba[J].Northern Horticulture,2018,42(12):1.[doi:10.11937/bfyy.20174451]

备注/Memo

第一作者简介：常婧（1990-），女，辽宁丹东人，硕士研究生，助理工程师，现主要从事森林培育与经营等研究工作。E-mail：350113050@qq.com.责任作者：刘明国(1964-)，男，辽宁朝阳人，博士，教授，现主要从事森林培育与经济林等研究工作。E-mail:liumingguo916@163.com.基金项目：辽宁特聘教授基金资助项目（2012）。收稿日期：2018-02-05

更新日期/Last Update: 2018-07-13