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Study on the Orthogonal Optimization of ISSR-PCR Reaction System of Rhododendron simsii(PDF)

《北方园艺》[ISSN:1001-0009/CN:23-1247/S]

Issue:
2015年14
Page:
111-114
Research Field:
Publishing date:

Info

Title:
Study on the Orthogonal Optimization of ISSR-PCR Reaction System of Rhododendron simsii
Author(s):
WANG Shuzhen; ZHA Sansheng; CHENG Cheng; ZHANG Chuanjin; FANG Yuanping; JIN Weibin
(Hubei Key Laboratory of Economic Forest Germplasm Improvement and Resource Comprehensive Utilization,Hubei Collaborative Innovation Center for the Characteristic Resources Exploitation of Dabie Mountains,College of Life Science，Huanggang Normal University，Huanggang,Hubei438000)
Keywords:
Rhododendron simsii; ISSR-PCR; primer screening; orthogonal optimization
PACS:
-
DOI:
10.11937/bfyy.201514029
Abstract:
Taking Rhododendron simsii as materaial，the orthogonal test system was adopted to establish the ISSR-PCR amplification system and optimize amplification condition for Rhododendron simsii.The effect of template DNA concentration，ISSR primer concentration，dNTPs concentration，Taq DNA polymerase concentration，and Mg2+ concentration on amplification results of ISSR-PCR were studied.The results showed that the optimal 20 μL ISSR-PCR reaction system including 60 ng genomic DNA，0.60 μmol/L primer，0.50 μmol/L dNTPs，30 U/mL Taq DNA polymerase，and 0.6 mmol/L Mg2+.This system also gave stable and reliable results in other ISSR primers.Therefore，the established ISSR-PCR reaction system would be helpful in the following genetic diversity analysis，the construction of ISSR fingerprints，phylogenetic analysis of R.simsii.

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Last Update: 2015-08-14